當QR碼在美國市場的使用度逐漸提高，有心人士似乎也找到了新的網路詐騙管道：幾位在俄國的Android手機用戶發現自己為了下載即時通訊軟體而掃瞄了平面條碼後，卻收到了要價昂貴的手機簡訊服務帳單。
這起事件由防毒軟體卡巴斯基實驗室回報，懷疑該QR碼可能遭到侵入並在Android手機中植入了木馬程式。由於QR碼可以連至任何網址，駭客想要中途作梗將連結導向惡意網頁並在手機上安裝木馬程式，並不是一件困難的事。值得注意的是，隨著QR碼在主流市場的接受度漸漸提高，這類詐騙事件將可能越來越常見，尤其是Android的手機用戶更應當心，因為比起競爭對手iOS，Android系統的「開放性」更容易讓有心人士有機可趁（iOS的用戶常連一般常見的檔案都無法開啟，更別說讓未授權的檔案對手機造成損害。）
就如同電子郵件與社群媒體在受到主流市場歡迎後，類似的惡意程式或詐騙手法也隨之風行，無論相同的模式會不會在QR碼上重演，手機用戶還是得一切小心為上。
