第408次太魯閣號事故在4月2日發生後3日，交通部部長林佳龍宣佈請辭負責。
林佳龍在積極奔走處理太魯閣號事故後，4日晚間11點在個人臉書上發佈聲明，事發當日就已經向總統請辭，只是他先求善後再求負責，選擇在搶救告一段落後，辭去交通部長一職，他指出，給罹難者最大的補償就是加速台鐵改革腳步。
林佳龍指出，從得知消息到前往事故現場，他祈求上天眷顧，讓乘客平安獲救。然而，壞消息接著傳來，每多一個罹難者，就多一個心碎的家庭，他內心只有更自責，更愧疚。
「作為交通部長，我責無旁貸，當然必須承擔起一切的責任，辭職下台是容易的事。我先是一個人，才是一個交通部長。在現場，每個人都很努力，想為罹難者、罹難者家屬及生還者多做一點事，盼望了解真相，盼望不會再有這樣的悲劇發生。」他指出。
以下為全文
林佳龍聲明稿：
從得知消息到前往事故現場，我祈求上天眷顧，讓乘客平安獲救。然而，壞消息接著傳來，每多一個罹難者，就多一個心碎的家庭，我內心只有更自責，更愧疚。
作為交通部長，我責無旁貸，當然必須承擔起一切的責任，辭職下台是容易的事。我先是一個人，才是一個交通部長。在現場，每個人都很努力，想為罹難者、罹難者家屬及生還者多做一點事，盼望了解真相，盼望不會再有這樣的悲劇發生。
第一天我即說會承擔一切政治責任，如同今天媒體所報導，佳龍當時即已向總統及院長請辭。這數日的批評，我本應概括承受，我們做得不夠好，我們改革的腳步不夠快，必須接受社會批判。辭職是最基本的負責，我留下的日子不是戀棧，而是求能善後。我在現場看到的是不斷湧入的民間救援力量，這股善念超越所有政治口水，我期盼台灣社會能走出傷痛，回歸理性的國家政策討論。我們能給罹難者最大的補償就是加速改革腳步，讓搭乘台鐵的乘客能得到一份安心。
回首這段日子，政府團結一心，克服了不少艱鉅的挑戰，也在疫情衝擊之際，與社會各界攜手共度難關；而總是站在危機最前線的交通部同仁，更是日日夜夜都經歷著數不盡的考驗。
儘管我們想努力做到最好，但這次發生的太魯閣列車事故，代表我們的努力還是不夠。目前事故及工安仍待運安會及司法單位調查，但那麼多罹難與身心受創的旅客及家屬，以及全體國人共同受傷的心靈，都令佳龍內心極為痛楚與自責。
佳龍會堅守崗位做好善後工作，在搶救的工作暫告一段落之際，不戀棧職位、負起完全責任，辭去交通部長一職。很抱歉因為在第一線協助搶救，不便即時向大家報告這項決定。
此刻，佳龍仍會全力協助搶救、搶修、撫卹、疏運及配合調查。未來離開交通部之後，也仍舊會把這些心情帶著，持續用不同的方式，盡力撫平傷亡者及家屬、以及全體國人的共同傷痛。
再次向全體國人致歉，也向每一位投入搶救的醫護、警消與協勤、疏運的人員致謝。天祐台灣！
